荧光原位杂交

实验原理

       将标记的核酸探针与细胞或组织中的核酸进行杂交,称为原位杂交。使用DNA或者RNA探针来检测与其互补的另一条链在细菌或其他真核细胞中的位置。

RNA原位核酸杂交又称RNA原位杂交组织化学或RNA原位杂交。该技术是指运用cRNA或寡核苷酸等探针检测细胞和组织内RNA表达的一种原位杂交技术。其基本原理是:在细胞或组织结构保持不变的条件下,用标记的已知的RNA核苷酸片段,按核酸杂交中碱基配对原则,与待测细胞或组织中相应的基因片段相结合(杂交),所形成的杂交体 (Hybrids)经显色反应后在光学显微镜或电子显微镜下观察其细胞内相应的mRNA、rRNA和tRNA分子。RNA原位杂交技术 经不断改进,其应用的领域已远超出DNA原位杂交技术。尤其在基因分析和诊断方面能作定性、定位和定量分析,已 成为最有效的分子病理学技术,同时在分析低丰度和罕见的mRNA表达方面已展示了分子生物学的一重要方向。

 

原位杂交实验步骤:前期胚胎的制备。

       原位杂交第一天进行重新水化和固定、预杂交、杂交。

       原位杂交第二天进行 1 将探针回收,放于-20C保存(通常探针可重复使用十次左右)2加入50%甲酰胺/2XSSCT溶液1毫升,60℃,放置30分钟,重复一次。3置换2XSSCT1ml,60℃,放置15分钟。4置换0.2XSSCT1ml,60℃,放置30分钟,重复一次。5用MABT洗两次,每次五分钟,放在摇床轻轻摇动。6室温下加1ml 1:2:7溶液,时间为一小时。  7  按1:3000的比例在1:2:7溶液中加入酶连地高辛抗体,4C 冰箱过夜。

       原位杂交第三天进行1) 用1ml含10%热灭活血清的MABT溶液置换抗体溶液,放置摇床上25分钟,然后用1mlMABT置换,25分钟,再用1mlMABT溶液置换,一小时以上,最后用1mlMABT溶液置换,25分钟。2) 用1ml 1mM**米睉的Staining buffer洗三次,每次放置五分钟。3)将胚胎转入十六孔板中,吸去staining buffer,加上300ul BM Purple AP Substrate(底物,用之前加5mM左旋米唑),十六孔板外面包上锡箔纸以避光,避免摇动,室温下显色。4)每隔一小时观察胚胎是否开始显色5)将显色完全的胚胎中的底物吸出,用PBST洗两三次后加上4%多聚甲醛固定,拍照。6)4C冰箱保存。

 

原位杂交服务内容

1. 细胞特异性mRNA转录的定位,可用于基因图谱,基因表达和基因组进化的研究;

2. 感染组织中病毒DNA/RNA的检测和定位,如EB病毒mRNA、人类**状瘤病毒和巨细胞病毒DNA的检测;

3. 癌基因、抑癌基因及各种功能基因在转录水平的表达及其变化的检测;

4. 基因在染色体上的定位;

5. 检测染色体的变化,如染色体数量异常和染色体易位等;

6. 分裂间期细胞遗传学的研究,如遗传病的产前诊断和某些遗传病基因携带者的确定,某些肿瘤的诊断和生物学剂量测定等。

 


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实验原理

       将标记的核酸探针与细胞或组织中的核酸进行杂交,称为原位杂交。使用DNA或者RNA探针来检测与其互补的另一条链在细菌或其他真核细胞中的位置。

RNA原位核酸杂交又称RNA原位杂交组织化学或RNA原位杂交。该技术是指运用cRNA或寡核苷酸等探针检测细胞和组织内RNA表达的一种原位杂交技术。其基本原理是:在细胞或组织结构保持不变的条件下,用标记的已知的RNA核苷酸片段,按核酸杂交中碱基配对原则,与待测细胞或组织中相应的基因片段相结合(杂交),所形成的杂交体 (Hybrids)经显色反应后在光学显微镜或电子显微镜下观察其细胞内相应的mRNA、rRNA和tRNA分子。RNA原位杂交技术 经不断改进,其应用的领域已远超出DNA原位杂交技术。尤其在基因分析和诊断方面能作定性、定位和定量分析,已 成为最有效的分子病理学技术,同时在分析低丰度和罕见的mRNA表达方面已展示了分子生物学的一重要方向。

 

原位杂交实验步骤:前期胚胎的制备。

       原位杂交第一天进行重新水化和固定、预杂交、杂交。

       原位杂交第二天进行 1 将探针回收,放于-20C保存(通常探针可重复使用十次左右)2加入50%甲酰胺/2XSSCT溶液1毫升,60℃,放置30分钟,重复一次。3置换2XSSCT1ml,60℃,放置15分钟。4置换0.2XSSCT1ml,60℃,放置30分钟,重复一次。5用MABT洗两次,每次五分钟,放在摇床轻轻摇动。6室温下加1ml 1:2:7溶液,时间为一小时。  7  按1:3000的比例在1:2:7溶液中加入酶连地高辛抗体,4C 冰箱过夜。

       原位杂交第三天进行1) 用1ml含10%热灭活血清的MABT溶液置换抗体溶液,放置摇床上25分钟,然后用1mlMABT置换,25分钟,再用1mlMABT溶液置换,一小时以上,最后用1mlMABT溶液置换,25分钟。2) 用1ml 1mM**米睉的Staining buffer洗三次,每次放置五分钟。3)将胚胎转入十六孔板中,吸去staining buffer,加上300ul BM Purple AP Substrate(底物,用之前加5mM左旋米唑),十六孔板外面包上锡箔纸以避光,避免摇动,室温下显色。4)每隔一小时观察胚胎是否开始显色5)将显色完全的胚胎中的底物吸出,用PBST洗两三次后加上4%多聚甲醛固定,拍照。6)4C冰箱保存。

 

原位杂交服务内容

1. 细胞特异性mRNA转录的定位,可用于基因图谱,基因表达和基因组进化的研究;

2. 感染组织中病毒DNA/RNA的检测和定位,如EB病毒mRNA、人类**状瘤病毒和巨细胞病毒DNA的检测;

3. 癌基因、抑癌基因及各种功能基因在转录水平的表达及其变化的检测;

4. 基因在染色体上的定位;

5. 检测染色体的变化,如染色体数量异常和染色体易位等;

6. 分裂间期细胞遗传学的研究,如遗传病的产前诊断和某些遗传病基因携带者的确定,某些肿瘤的诊断和生物学剂量测定等。

 


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2019 - 03 - 21
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全基因组测序分为:从头测序(de novo sequencing)和重测序(re-sequencing)。       从头测序(de novo):不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序,利用生物信息学分析方法进行拼接、组装,获得该物种的基因组序列图谱,从而推进该物种的后续研究。基因组重测序: 是对有参考基因组物种的不同个体进行的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。基因组重测序主要用于辅助研究者发现单核苷酸多态性位点(SNPs)、拷贝数变异(CNV)、插入/缺失(Indel)等变异类型,以较低的价格将单个参考基因组信息扩增为生物群体的遗传特征。全基因组重测序在人类疾病和动植物育种研究中广泛应用。技术路线 生物信息分析
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