据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展,事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐,现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述:

非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库?

1.HMDB

非靶向代谢组学的代谢通路必须借助多类不同的数据库进行准确分析。比如进行动物粪便代谢产物分析时,若是没有有力的数据库进行源数据对比分析,那么便难以确定动物粪便代谢产物中包括哪些未知成分,而HMDB数据库已收集了大量适用于鉴定体内内源性代谢物的参考数据。

2.KEGG

KEGG是集合了众多大型分子数据集生成的基因组测序的实用程序数据库资源,选用这个数据库里面的资源对于提升非靶向代谢组学研究效率具有巨大的帮助。KEGG有助于帮助分析人员筛别动物粪便代谢的生物学信息、基因和蛋白质信息,从而便于提升代谢组学研究的准确性。

3.Reactome

非靶向代谢组学还适宜选用Reactome这类代谢组学通路数据库。Reactome以收集信号通路数据为主,而KEGG更侧重于代谢通路,故而在实际应用中可选用Reactome对动物粪便代谢进行差异表达基因分析。

非靶向代谢组学的研究内容博大精深,它的代谢通路和互作网络分析就拥有多种通路数据库。这也是越来越多相信销量好的非靶向代谢组学研究成果的重要原因之一,事实上代谢组学通路数据库除了适宜选用HMDB、KEGG以及Reactome外,还可以选用BioCyc与MetaCyc等其它类别的数据库。

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