在非靶向代谢组学中有诸多前卫理论被大量应用，由于该种代谢组学获得的实验数据可利用性更高，所以被许多行业所重视，代谢组学的整个数据处理流程中需要应用到各种软件和数据库，所以它的前期投入的成本花费并不低，那么为什么要对非靶向代谢组学进行深入研究呢？

1、应用领域广泛

靶向代谢组学‍是系统性的研究生物系统里各种生化进程产生的代谢物特征的研究领域，通过结合代谢祖学、基因组学、蛋白组学等先进技术手段，能够帮助科研人员更加系统和全面的理解细胞生物学，被越来越多的应用于各个领域，比如生命科学、医学、食品科学、环境科学等。非靶向代谢组学常用的检测方式主要是核磁共振和质谱，而质谱通常和不同的色谱系统联用，通过不同分子的保留时间不同，来区分质荷比（分子量／电荷）接近的分子。

2、检测代谢物种类多样

生物样本中的代谢物种类成千上万，浓度也有巨大的差别，并非一次检测就能检测到所有的代谢物，检测到的代谢物定量的准确性也是不一样的，所以要运用到非靶向代谢组学知识。如果要追求对某几个或者一类代谢物更加准确的定量，则会采用非靶向代谢组学的方法，需要有丰富经验专家的对样本的预处理，分离方法，内标等步骤进行优化，检测的时间和成本也会增加。如果是初次的探索性代谢组学研究，很多时候都会选择靶向代谢组学‍的方法，来检测比如氨基酸、三羧酸循环、糖酵解、核酸代谢等多条代谢通路中的相关代谢物。

而且目前非靶向代谢组学一直致力于进行多元化的研究，推动了各个行业之间的相容性，从投入的科研力量上来看逐年增加，这也充分说明各个行业对于该种代谢组学十分重视，在未来各个领域应用非靶向代谢组学后将会提高该种学科门类的实践性。