人类生物科学的发展离不开科学的检测和分析，所以任何与生物或者微生物相关的测试或者实验都需要使用评价好的微生物多样性检测，由于现在需要了解微生物情况的行业比较多，所以通常在以下行业中都需要采用微生物多样性检测。

一、医药领域

生物科技的发展在医疗行业的表现更为明显，这是因为只有人们对微生物更加了解才能让人们消除不利于身体的病毒，同时进一步培养有利于健康的有益细菌，但是想要了解医药品中菌群的情况就需要使用专业的设备检测，而这个检测就是有效的微生物多样性检测，所以在医药领域之中微生物多样性检测使用率很高。

二、环境生态学领域

提到生态环境就要说到人们所生活中的自然资源，比如空气、土壤及水源，因为我们生活的环境中是无法做到采用肉眼或者人体感官确定环境好坏的，因为空气、土壤和水源中微生物情况才能确定生态环境的状态，所以在环境生态学领域中同样会用到微生物多样性检测，并由检测结果来确定生态环境的好坏。

三、食品领域

微生物多样性检测还会应用在大众比较熟悉的视频领域中，这是因为食品安全与否关乎到全民的身体健康，而食品安全就要通过微生物多样性检测来获得一定的数据，所以现在涉及到食品的行业中都会使用这样的检测，尤其是婴幼儿的食品检测更为严格和多样。

微生物多样性检测是专门检测微生物种类和数据的测试，所以只要涉及到微生物分析和检测的行业就需要用到这类检测，这些行业中除了被大众知晓的医疗、环境生态、及食品行业以外，其实在很多与人们生活息息相关的日用品也需要这样的检测。